Un organisme microscopique révèle des anomalies dans le code génétique
Un test visant à explorer les limites du séquençage de l’ADN à partir de cellules uniques a révélé une découverte inattendue : un organisme microscopique provenant d’un étang dans les parcs de l’Université d’Oxford semble utiliser le code génétique d’une manière inédite.
Dr. Jamie McGowan, chercheur postdoctoral à l’Earlham Institute, étudiait le génome d’un protiste collecté dans une source d’eau douce. L’objectif était d’évaluer un pipeline de séquençage de l’ADN capable de fonctionner avec de très petites quantités d’ADN, y compris celui d’une seule cellule. Au lieu de cela, l’équipe a identifié un outsider génétique inattendu, l’organisme, désigné comme Oligohymenophorea sp. PL0344, se révélant être une espèce inconnue avec une variation rare dans la manière dont il interprète les instructions génétiques et construit des protéines. Une étude publiée dans PLOS Genetics a rapporté que deux codons, normalement associés à des signaux d’arrêt génétique, avaient été réaffectés à différents acides aminés, une combinaison décrite comme inédite par les chercheurs.
Les protistes, qui comprennent des organismes unicellulaires tels que les amibes et les algues, ainsi que des formes multicellulaires comme les algues brunes, sont difficiles à définir en raison de leur diversité. Dr. McGowan a noté que « la définition d’un protiste est vague — essentiellement, il s’agit de tout organisme eucaryote qui n’est ni un animal, ni une plante, ni un champignon. »
Dans Oligohymenophorea sp. PL0344, seul le codon TGA semble fonctionner comme un signal d’arrêt. Les autres signaux, TAA et TAG, ont été réaffectés pour spécifier respectivement la lysine et l’acide glutamique. Cette découverte remet en question certaines règles établies sur la traduction des gènes, car il n’existe pas d’autre cas connu où ces codons sont liés à deux acides aminés différents.
Les résultats soulignent que le code génétique, généralement considéré comme universel, peut être plus flexible que prévu, même dans des systèmes biologiques conservés. Des études ultérieures ont renforcé l’idée que les ciliés, comme Oligohymenophorea, représentent des sources riches en surprises génétiques.
La recherche originale a été publiée dans PLOS Genetics en 2023 et a été financée par le Wellcome Trust, dans le cadre du projet Darwin Tree of Life, avec le soutien de l’Earlham Institute et du Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC).
Source : PLOS Genetics
