Quand la génomique s’inspire du traitement du langage naturel
Mise à jour le 2025-11-27 15:16:00 : Une conférence présentera comment la génomique intègre des techniques de traitement du langage naturel. Cette approche pourrait transformer la recherche en biologie.
Les pangénomes représentent la diversité génétique d’une population sous forme de graphes, en répertoriant les variations communes et accessoires. La croissance exponentielle du séquençage rend ces structures de plus en plus complexes à optimiser et à explorer à grande échelle. En parallèle, le traitement automatique du langage (NLP) a transformé la représentation des connaissances en apprenant à partir de corpus non annotés grâce à des modèles fondamentaux auto-supervisés.
Ce qu’il faut savoir
- Le fait : La génomique utilise des modèles de langage pour analyser l’ADN brut.
- Qui est concerné : Chercheurs en biologie et en génomique.
- Quand : 27 novembre 2025.
Concrètement, pour vous
- Ce qui change : Une nouvelle méthode d’analyse de l’ADN pourrait améliorer les recherches en biologie.
- Démarches utiles : Participation à la session de posters après la conférence.
Contexte
Cette présentation propose une synthèse du fonctionnement des LLMs (Large Language Models) et de leur adaptation croissante à la génomique, dans un écosystème de modèles en plein essor. Nous illustrerons ces capacités avec Evo/Evo2, qui permettent l’évaluation sans entraînement préalable des effets de variants et de l’essentialité des gènes, ainsi que la génération de promoteurs, opérons et constructions multi-gènes. Enfin, nous aborderons les enjeux, biais et perspectives de recherche nécessaires pour garantir une application fiable en biologie.
Citation
« Une conférence de Guillaume Gautreau, chargé de recherche à l’INRAE – Jouy-en-Josas. »
Sources
« L’article est apparu en premier ici »
Date de publication : 2025-11-27 15:16:00
Auteur : Cédric Balcon-Hermand – Consulter sa biographie, ses projets et son travail. Article vérifié, recoupé, reformulé et enrichi selon la ligne éditoriale Artia13, sans reprise d’éléments protégés.
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